ઇથોપિયામાં SARS-CoV-2 ને ઓળખવા માટે ચાર ન્યુક્લીક એસિડ એમ્પ્લીફિકેશન એસેસનું પ્રદર્શન

Nature.com ની મુલાકાત લેવા બદલ આભાર. તમે મર્યાદિત CSS સપોર્ટ સાથે બ્રાઉઝર સંસ્કરણનો ઉપયોગ કરી રહ્યાં છો. શ્રેષ્ઠ અનુભવ માટે, અમે ભલામણ કરીએ છીએ કે તમે અપડેટ કરેલ બ્રાઉઝરનો ઉપયોગ કરો (અથવા Internet Explorer માં સુસંગતતા મોડને અક્ષમ કરો). વધુમાં, ચાલુ સમર્થનની ખાતરી કરવા માટે, અમે શૈલીઓ અને JavaScript વિના સાઇટ બતાવીએ છીએ.
એક સાથે ત્રણ સ્લાઇડ્સનું કેરોયુઝલ પ્રદર્શિત કરે છે. એક સમયે ત્રણ સ્લાઇડ્સમાંથી આગળ વધવા માટે પાછલા અને આગલા બટનોનો ઉપયોગ કરો અથવા એક સમયે ત્રણ સ્લાઇડ્સમાંથી આગળ વધવા માટે અંતે સ્લાઇડર બટનનો ઉપયોગ કરો.
2019 કોરોનાવાયરસ રોગ (COVID-19) ફાટી નીકળ્યો ત્યારથી, ઘણા વ્યાવસાયિક ન્યુક્લીક એસિડ એમ્પ્લીફિકેશન પરીક્ષણો (NAATs) વિશ્વભરમાં વિકસાવવામાં આવ્યા છે અને તે પ્રમાણભૂત પરીક્ષણો બની ગયા છે. જો કે ઘણા પરીક્ષણો ઝડપથી વિકસાવવામાં આવ્યા હતા અને પ્રયોગશાળા ડાયગ્નોસ્ટિક પરીક્ષણો પર લાગુ કરવામાં આવ્યા હતા, આ પરીક્ષણોના પ્રદર્શનનું વિવિધ સેટિંગ્સમાં મૂલ્યાંકન કરવામાં આવ્યું નથી. તેથી, આ અભ્યાસનો હેતુ એબોટ SARS-CoV-2, દાન જનીન, BGI અને સેન્સ્યોર બાયોટેક એસેના પ્રભાવનું મૂલ્યાંકન કરવાનો છે કોમ્પોઝિટ રેફરન્સ સ્ટાન્ડર્ડ (CRS) નો ઉપયોગ કરીને. આ અભ્યાસ ઇથોપિયન પબ્લિક હેલ્થ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ (EPHI) ખાતે 1 થી 30 ડિસેમ્બર 2020 દરમિયાન હાથ ધરવામાં આવ્યો હતો. QIAamp RNA મિની કીટ અને એબોટ DNA નમૂના તૈયારી પ્રણાલીનો ઉપયોગ કરીને 164 નેસોફેરિંજલ નમૂનાઓ કાઢવામાં આવ્યા હતા. 164 નમૂનાઓમાંથી, 59.1% હકારાત્મક અને 40.9% CRS માટે નકારાત્મક હતા. CRS (p <0.05) ની સરખામણીમાં સેન્સ્યોર બાયોટેક પોઝીટીવીટી નોંધપાત્ર રીતે ઓછી હતી. CRS (p <0.05) ની સરખામણીમાં સેન્સ્યોર બાયોટેક પોઝીટીવીટી નોંધપાત્ર રીતે ઓછી હતી. Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p < 0,05). સેન્સ્યોર બાયોટેકના હકારાત્મક પરિણામો CRS (p <0.05) ની સરખામણીમાં નોંધપાત્ર રીતે ઓછા હતા.与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低(p <0.05).与CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低(p <0.05). У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). CRS (p <0.05) ની સરખામણીમાં સેન્સ્યોર બાયોટેકના નોંધપાત્ર પ્રમાણમાં ઓછા હકારાત્મક પરિણામો હતા.ચાર વિશ્લેષણનો એકંદર કરાર CRS ની સરખામણીમાં 96.3–100% હતો. સેન્સ્યોર બાયોટેક પરીક્ષાના નીચા હકારાત્મકતા દર ઉપરાંત, ચાર પરીક્ષાઓની કામગીરી લગભગ તુલનાત્મક હતી. જેમ કે, સેન્સ્યોર બાયોટેક [રિસર્ચ ઓન્લી (RUO)] એસે ઇથોપિયામાં તેના ઉપયોગ માટે વધારાની માન્યતાની જરૂર છે. છેલ્લે, યોગ્ય ઉત્પાદકના દાવાઓ સાથેના મૂલ્યાંકન માટે વધારાના સંશોધનને ધ્યાનમાં લેવું જોઈએ.
લેબોરેટરી પરીક્ષણ એ વિશ્વ આરોગ્ય સંસ્થા (WHO)ની કોરોનાવાયરસ રોગ 2019 (COVID-19) તૈયારી અને પ્રતિભાવ (SPRP) માટેની વ્યૂહાત્મક યોજનાનો એક ભાગ છે. WHO સલાહ આપે છે કે દેશોએ સજ્જતા, યોગ્ય કેસ મેનેજમેન્ટ, તકેદારી અને જાહેર આરોગ્ય પડકારોનો ઝડપી પ્રતિસાદ સુધારવા માટે પ્રયોગશાળા ક્ષમતા બનાવવાની જરૂર છે. આ સૂચવે છે કે ઉભરતા ચેપી એજન્ટોના રોગ અને રોગચાળાના લક્ષણો અને તેમના ફેલાવાને નિયંત્રિત કરવા માટે પ્રયોગશાળાની ભૂમિકા ચાવીરૂપ છે.
COVID-19 ના નિદાન માટે રોગચાળા અને તબીબી માહિતી, વ્યક્તિગત લક્ષણો/ચિહ્નો અને રેડિયોગ્રાફિક અને લેબોરેટરી ડેટા2ની જરૂર છે. ચીનના વુહાનમાં COVID-19 ફાટી નીકળ્યાની જાણ થઈ ત્યારથી, વિશ્વભરમાં ઘણા વ્યાવસાયિક ન્યુક્લિક એસિડ એમ્પ્લીફિકેશન ટેસ્ટ (NAATs) વિકસાવવામાં આવ્યા છે. રીઅલ-ટાઇમ રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્શન પોલિમરેઝ ચેઇન રિએક્શન (rRT-PCR) નો ઉપયોગ ગંભીર એક્યુટ રેસ્પિરેટરી સિન્ડ્રોમ 2 (SARS-CoV-2)3 ચેપના પ્રયોગશાળા નિદાન માટે નિયમિત અને પ્રમાણભૂત પદ્ધતિ તરીકે કરવામાં આવે છે. SARS-CoV-2 ની પરમાણુ શોધ સામાન્ય રીતે ORF1a/b (ઓપન રીડિંગ ફ્રેમ 1a/b) માં N (ન્યુક્લિયોકેપ્સિડ પ્રોટીન જનીન), E (એન્વેલોપ પ્રોટીન જનીન), અને RdRp (RNA-આધારિત RNA પોલિમરેઝ જનીન) પર આધારિત છે. . જનીન) વાયરલ જીનોમ પરથી ઓળખાયેલ પ્રદેશ. તેઓને વાઈરસ ઓળખાણ4 માટે વાયરલ જીનોમમાં જોવા મળતા મુખ્ય સંરક્ષિત પ્રદેશો ગણવામાં આવે છે. આ જનીનોમાં, RdRp અને E જનીનોમાં ઉચ્ચ વિશ્લેષણાત્મક તપાસ સંવેદનશીલતા હોય છે, જ્યારે N જનીનમાં નીચી વિશ્લેષણાત્મક સંવેદનશીલતા હોય છે.
પીસીઆર એસેઝનું પ્રદર્શન વિવિધ પરિબળોને આધારે બદલાઈ શકે છે જેમ કે: નિષ્કર્ષણ રીએજન્ટ્સ, એમ્પ્લીફિકેશન/શોધ રીએજન્ટ્સ, નિષ્કર્ષણ પદ્ધતિ, પીસીઆર મશીનની ગુણવત્તા અને અન્ય સાધનો. એપ્રિલ 2020 સુધીમાં, નવ દેશોમાંથી 48 થી વધુ વિવિધ ડાયગ્નોસ્ટિક ઉપકરણોને COVID-196 નિદાન માટે કટોકટી ઉપયોગ અધિકૃતતા (EUA) પ્રાપ્ત થઈ છે. ઇથોપિયામાં, ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 અને Quant-studio7 સહિત 26 જાહેર આરોગ્ય સંસ્થાઓમાં SARS-CoV-2 ના PCR શોધ માટે 14 થી વધુ રીઅલ-ટાઇમ PCR પ્લેટફોર્મનો ઉપયોગ કરવામાં આવે છે. આ ઉપરાંત, વિવિધ PCR ટેસ્ટ કિટ્સ ઉપલબ્ધ છે, જેમ કે દાન જીન ટેસ્ટ, એબોટ SARS-CoV-2 ટેસ્ટ, Sansure Biotech ટેસ્ટ અને SARS-CoV-2 BGI ટેસ્ટ. rRT-PCR અત્યંત સંવેદનશીલ હોવા છતાં, અયોગ્ય સંગ્રહ, પરિવહન, સંગ્રહ અને હેન્ડલિંગ અને પ્રયોગશાળા પરીક્ષણને કારણે નમૂનાઓમાં વાયરલ રિબોન્યુક્લિક એસિડ (RNA) ની અપૂરતી નકલોને કારણે COVID-19 ધરાવતા કેટલાક દર્દીઓ ખોટા નકારાત્મક પરિણામોની જાણ કરે છે. કર્મચારીઓની શરતો અને ક્રિયાઓ8. આ ઉપરાંત, સેમ્પલ અથવા કંટ્રોલ મિસહેન્ડલિંગ, સાયકલ થ્રેશોલ્ડ (Ct) સેટિંગ અને અન્ય પેથોજેનિક ન્યુક્લિક એસિડ અથવા નિષ્ક્રિય/અવશેષ SARS-CoV-2 RNA સાથે ક્રોસ-રિએક્ટિવિટી rRT-PCR9 એસેમાં ખોટા હકારાત્મક પરિણામો તરફ દોરી શકે છે. આમ, તે સ્પષ્ટ છે કે પીસીઆર પરીક્ષણો ખરેખર જનીન ટુકડાઓના વાહકોને ઓળખી શકે છે, કારણ કે તેઓ ખરેખર સક્રિય વાયરલ જનીનો વચ્ચે તફાવત પણ કરી શકતા નથી, તેથી પરીક્ષણો ફક્ત વાહકોને ઓળખી શકે છે દર્દીઓ10 નહીં. તેથી, અમારા સેટિંગમાં માનક પદ્ધતિઓનો ઉપયોગ કરીને ડાયગ્નોસ્ટિક કામગીરીનું મૂલ્યાંકન કરવું મહત્વપૂર્ણ છે. ઇથોપિયન પબ્લિક હેલ્થ ઇન્સ્ટિટ્યૂટ (EPHI) અને સમગ્ર દેશમાં ઘણા NAAT રીએજન્ટ્સ ઉપલબ્ધ હોવા છતાં, તેમની અસરકારકતાનું કોઈ તુલનાત્મક મૂલ્યાંકન હજુ સુધી નોંધાયું નથી. તેથી, આ અભ્યાસનો ઉદ્દેશ્ય ક્લિનિકલ નમૂનાઓનો ઉપયોગ કરીને rRT-PCR દ્વારા SARS-CoV-2 ની શોધ માટે વ્યાપારી રીતે ઉપલબ્ધ કિટની તુલનાત્મક કામગીરીનું મૂલ્યાંકન કરવાનો છે.
આ અભ્યાસમાં શંકાસ્પદ COVID-19 ધરાવતા કુલ 164 સહભાગીઓનો સમાવેશ કરવામાં આવ્યો હતો. મોટાભાગના નમૂનાઓ સારવાર કેન્દ્રોમાંથી હતા (118/164 = 72%), જ્યારે બાકીના 46 (28%) સહભાગીઓ બિન-સારવાર કેન્દ્રોમાંથી હતા. કેન્દ્રમાં સારવાર ન કરાયેલ સહભાગીઓમાં, 15 (9.1%) ને તબીબી રીતે શંકાસ્પદ કેસો હતા અને 31 (18.9%) ને પુષ્ટિ થયેલ કેસોના સંપર્કો હતા. નેવું-ત્રણ (56.7%) સહભાગીઓ પુરુષ હતા, અને સહભાગીઓની સરેરાશ (± SD) ઉંમર 31.10 (± 11.82) વર્ષ હતી.
આ અભ્યાસમાં, COVID-19 માટે ચાર પરીક્ષણોના સકારાત્મક અને નકારાત્મક દરો નક્કી કરવામાં આવ્યા હતા. આમ, એબોટ SARS-CoV-2 એસે, Daan Gene 2019-nCoV એસે, SARS-CoV-2 BGI એસે, અને સેન્સ્યોર બાયોટેક 2019-nCoV એસેના સકારાત્મક દર અનુક્રમે 59.1%, 58.5%, 57.9% અને 55% હતા. . હકારાત્મક અને નકારાત્મક સંયુક્ત સંદર્ભ ધોરણ (CRS) સ્કોર્સ અનુક્રમે 97 (59.1%) અને 67 (40.9%) હતા (કોષ્ટક 1). આ અભ્યાસમાં, CRS ની વ્યાખ્યા "કોઈપણ સકારાત્મક" નિયમ પર આધારિત હતી, જેમાં ચાર પરીક્ષણ પરિણામોમાંથી, સમાન પરિણામ આપનાર બે અથવા વધુ પરીક્ષણ પરિણામોને સાચા હકારાત્મક અથવા નકારાત્મક ગણવામાં આવ્યા હતા.
આ અભ્યાસમાં, અમને CRS ની તુલનામાં તમામ વિશ્લેષણો માટે 100% (95% CI 94.6–100) નો નકારાત્મક ટકાવારી કરાર (NPA) મળ્યો. સેન્સ્યોર બાયોટેક્નોલોજી વિશ્લેષણે 93.8% (95% CI 87.2-97.1) નો ન્યૂનતમ PPA દર્શાવ્યો હતો અને Daan Gene 2019-nCoV વિશ્લેષણમાં 99.4% (95% CI 96.6-99.9) નો એકંદર કરાર હતો. તેનાથી વિપરીત, SARS-CoV-2 BGI એસે અને Sansure Biotech 2019-nCoV એસે વચ્ચેનો એકંદર કરાર અનુક્રમે 98.8% અને 96.3% હતો (કોષ્ટક 2).
CRS અને Abbott SARS-CoV-2 એસે પરિણામો વચ્ચે કરારનો કોહેનનો કપ્પા ગુણાંક સંપૂર્ણપણે સુસંગત હતો (K = 1.00). તેવી જ રીતે, Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI, અને Sansure Biotech 2019-nCoV દ્વારા શોધાયેલ કોહેનના કપ્પા મૂલ્યો પણ CRS (K ≥ 0.925) સાથે સંપૂર્ણપણે સુસંગત છે. આ તુલનાત્મક પૃથ્થકરણમાં, ચી-સ્ક્વેર ટેસ્ટ (મેકનેમર ટેસ્ટ) દર્શાવે છે કે સેન્સ્યોર બાયોટેક 2019-nCoV પરીક્ષાના પરિણામો CRS પરિણામો (p = 0.031) (કોષ્ટક 2) કરતા નોંધપાત્ર રીતે અલગ હતા.
ફિગ માં બતાવ્યા પ્રમાણે.1 એબોટ SARS-CoV-2 એસે (સંયુક્ત RdRp અને N જનીન) ની સૌથી નીચી Ct મૂલ્ય (< 20 Ct) ની ટકાવારી 87.6% હતી અને ORF1a/b જનીન Ct મૂલ્ય સેન્સ્યોર બાયોટેક 2019-nCoV પરીક્ષણ દર્શાવે છે કે ટકાવારી ઓછી છે. Ct મૂલ્ય (< 20 Ct) 50.3% અને ઊંચું હતું Ct મૂલ્ય (36–40 Ct) 3.2% હતું. 1 એબોટ SARS-CoV-2 એસે (સંયુક્ત RdRp અને N જનીન) ની સૌથી નીચી Ct મૂલ્ય (< 20 Ct) ની ટકાવારી 87.6% હતી અને ORF1a/b જનીન Ct મૂલ્ય સેન્સ્યોર બાયોટેક 2019-nCoV પરીક્ષણ દર્શાવે છે કે ટકાવારી ઓછી છે. Ct મૂલ્ય (< 20 Ct) 50.3% અને ઊંચું હતું Ct મૂલ્ય (36–40 Ct) 3.2% હતું.ફિગ માં બતાવ્યા પ્રમાણે.1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) અનાલિઝા એબોટ SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) составил 87,6%, Ct/Abt анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (<20 Ct) составлял 50,3%, а высокое значение Ct (Ct046) 3,2%. 1, એબોટ SARS-CoV-2 (સંયુક્ત જનીન RdRp અને N) ના સૌથી ઓછા Ct મૂલ્ય (< 20 Ct) વિશ્લેષણની ટકાવારી 87.6% હતી, અને Sansure Biotech 2019-nCoV ના ORF1a/b જનીન વિશ્લેષણનું Ct મૂલ્ય દર્શાવે છે. જે નીચા Ct મૂલ્યની ટકાવારી (< 20 Ct) માટે જવાબદાર છે 50.3%, અને ઉચ્ચ મૂલ્ય Ct (36–40 Ct) 3.2% માટે જવાબદાર છે.如图1 所示,Abbot SARS-CoV-2 检测(结合RdRp 和N 基因)的最低Ct 值百分比(< 20 Ct.S7% બાયોટેક. 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(< 20 Ct) 的百分比为50.3%,高Ct 值的(36–40 Ct. 36–40%) આકૃતિ 1 માં બતાવ્યા પ્રમાણે, એબોટ SARS-CoV-2 પરીક્ષણ (RdRp અને N જનીનનું સંયોજન) ની સૌથી ઓછી Ct મૂલ્ય ટકાવારી (< 20 Ct) 87.6% છે, Sansure Biotech 2019-nCoV પરીક્ષણનું ORF1a/b જનીન Ct મૂલ્ય છે. નીચા Ct值(< 20 Ct) ની ટકાવારી દર્શાવે છે 50.3%, 高Ct 值(36–40 Ct)% ટકાવારી 3.2% છે. Как показано на рисунке 1, એબોટ SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) имел самое низкое процентное значение Ct<b> 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b માં исследовании Sansure Biotech 2019- Analiz nCoV показал низкий Ct. આકૃતિ 1 માં બતાવ્યા પ્રમાણે, એબોટ SARS-CoV-2 એસે (RdRp અને N જનીનોને સંયોજિત કરીને) સૌથી ઓછી ટકાવારી Ct મૂલ્ય (< 20 Ct) 87.6% ધરાવે છે, જ્યારે સેન્સ્યોરમાં ORF1a/b જનીનનું Ct મૂલ્ય બાયોટેક 2019 અભ્યાસ - nCoV ના વિશ્લેષણમાં નીચી સીટી દર્શાવવામાં આવી છે. Процент значений (<20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) составил 3,2%. મૂલ્યોની ટકાવારી (<20 Ct) 50.3% હતી, અને ઉચ્ચ Ct મૂલ્યોની ટકાવારી (36–40 Ct) 3.2% હતી.એબોટ SARS-CoV-2 B પરીક્ષણમાં 30 થી ઉપરના Ct મૂલ્યો નોંધાયા છે. બીજી તરફ, BGI SARS-CoV-2 પર ORF1a/b જનીનનું ઉચ્ચ Ct મૂલ્ય (> 36 Ct) ટકાવારી 4% હતી (ફિગ. 1). બીજી તરફ, BGI SARS-CoV-2 પર ORF1a/b જનીનનું ઉચ્ચ Ct મૂલ્ય (> 36 Ct) ટકાવારી 4% હતી (ફિગ. 1). С другой стороны, BGI SARS-CoV-2 gen ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которого составля (%41ris). બીજી તરફ, BGI SARS-CoV-2 જનીન ORF1a/b ના વિશ્લેષણમાં Ct મૂલ્ય (> 36 Ct) હતું, જેની ટકાવારી 4% હતી (ફિગ. 1).另一方面,BGI SARS-CoV-2 检测中,ORF1a/b 基因具有高Ct 值(> 36 Ct)的百分比为4%(弉 બીજી બાજુ, BGI SARS-CoV-2 શોધમાં, ઉચ્ચ Ct મૂલ્ય (>36 Ct) સાથે ORF1a/b જનીનની ટકાવારી 4% છે (આકૃતિ 1). С другой стороны, BGI SARS-CoV-2 PROcent генов ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (ris.1). બીજી બાજુ, BGI SARS-CoV-2 વિશ્લેષણમાં, ઉચ્ચ Ct મૂલ્યો (>36 Ct) સાથે ORF1a/b જનીનોની ટકાવારી 4% (ફિગ. 1) હતી.
આ અભ્યાસમાં, અમે 164 નેસોફેરિંજલ સેમ્પલ લીધા. તમામ પ્રકારના પરીક્ષણો માટે, સંબંધિત ઉત્પાદકો દ્વારા ભલામણ કરાયેલ પદ્ધતિઓ અને કિટ્સનો ઉપયોગ કરીને આરએનએ અલગતા અને એમ્પ્લીફિકેશન કરવામાં આવ્યું હતું.
આ અભ્યાસ દર્શાવે છે કે SARS-CoV-2 માટે એબોટના પરીક્ષણમાં 100% સકારાત્મક, નકારાત્મક અને એકંદર સુસંગતતા સાથે, CRS જેવી જ તપાસ કામગીરી છે. કોહેનનો કપ્પા કરાર 1.00 છે, જે CRS સાથે સંપૂર્ણ કરાર દર્શાવે છે. યુ.એસ.માં યુનિવર્સિટી ઓફ વોશિંગ્ટન દ્વારા સમાન અભ્યાસમાં જાણવા મળ્યું છે કે સીડીસીની લેબોરેટરી-નિર્ધારિત પરીક્ષા (એલડીએ) ની તુલનામાં SARS-CoV-2 માટે એબોટ ટેસ્ટની એકંદર સંવેદનશીલતા અને વિશિષ્ટતા અનુક્રમે 93% અને 100% હતી. . 11. એબોટ SARS-CoV-2 ડિટેક્શન સિસ્ટમ N અને RdRp જનીનોની એકસાથે સંયુક્ત તપાસ પર આધારિત છે, કારણ કે બંને જનીનો વધુ સંવેદનશીલ છે, ખોટા નકારાત્મકને ઘટાડે છે12. વિયેના, ઑસ્ટ્રિયામાં થયેલા એક અભ્યાસમાં એ પણ દર્શાવવામાં આવ્યું છે કે મોટા નિષ્કર્ષણ નમૂનાના જથ્થા અને ડિટેક્શન ઇલ્યુએન્ટ વોલ્યુમોએ મંદન અસરોને ઘટાડી છે અને શોધ કાર્યક્ષમતા વધારી છે13. આમ, SARS-CoV-2 એસે માટે એબોટની સંપૂર્ણ મેચ પ્લેટફોર્મ ડિટેક્શન સિસ્ટમ સાથે સંકળાયેલ હોઈ શકે છે જે એકસાથે કોમ્બિનેટરીયલ જનીનોને શોધી કાઢે છે, મોટી સંખ્યામાં નમૂનાઓ (0.5 ml) કાઢે છે અને મોટી માત્રામાં ઇલ્યુએન્ટ (40 μl) નો ઉપયોગ કરે છે.
અમારા પરિણામોએ એ પણ દર્શાવ્યું છે કે દાન આનુવંશિક પરીક્ષણની તપાસ કામગીરી લગભગ CRS જેટલી જ હતી. આ હુએનાન, ચીનમાં Anhui યુનિવર્સિટી ખાતે હાથ ધરવામાં આવેલા અભ્યાસ14 અને 100% હકારાત્મક કરારના ઉત્પાદકના દાવા સાથે સુસંગત છે. સાતત્યપૂર્ણ પરિણામોના અહેવાલો હોવા છતાં, એક જ ઇલ્યુએટનું ફરીથી પરીક્ષણ કર્યા પછી એક નમૂનો ખોટો નકારાત્મક હતો, પરંતુ એબોટ SARS-CoV-2 અને Sansure Biotech nCoV-2019 એસેઝમાં તે સકારાત્મક હતો. આ સૂચવે છે કે વિવિધ પ્રકારની પરીક્ષાઓમાં પરિણામોમાં પરિવર્તનશીલતા હોઈ શકે છે. તેમ છતાં, ચાઇના15 માં હાથ ધરવામાં આવેલા અભ્યાસમાં, દાન જનીન પરીક્ષાનું પરિણામ તેમના પ્રયોગશાળા-વ્યાખ્યાયિત સંદર્ભ પરીક્ષાની તુલનામાં નોંધપાત્ર રીતે અલગ (p <0.05) હતું. તેમ છતાં, ચાઇના15 માં હાથ ધરવામાં આવેલા અભ્યાસમાં, દાન જનીન પરીક્ષાનું પરિણામ તેમના પ્રયોગશાળા-વ્યાખ્યાયિત સંદર્ભ પરીક્ષાની તુલનામાં નોંધપાત્ર રીતે અલગ (p <0.05) હતું. Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) от эбноголотах માન્યતા જોકે, ચાઇના15માં થયેલા એક અભ્યાસમાં, ડાન જીનનું વિશ્લેષણ પરિણામ તેમના પ્રયોગશાળા સંદર્ભ વિશ્લેષણ કરતાં નોંધપાત્ર રીતે અલગ (p <0.05) હતું.然而,在中国进行的研究中15,大安基因检测的结果与其实验室定义漈澀参考检测縭<0.05).然而,在中国进行的研究中15,大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测縭15 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отличались (p < 0,05) погений эталонным лабораторным тестом. જો કે, ચીન15માં થયેલા એક અભ્યાસમાં, દાનના આનુવંશિક પરીક્ષણના પરિણામો તેના સંદર્ભ પ્રયોગશાળા પરીક્ષણની તુલનામાં નોંધપાત્ર રીતે અલગ (p <0.05) હતા.આ વિસંગતતા SARS-CoV-2 ને શોધવા માટે સંદર્ભ પરીક્ષણની સંવેદનશીલતાને કારણે હોઈ શકે છે, અને કારણ નક્કી કરવા માટે વધુ અભ્યાસ મહત્વપૂર્ણ હોઈ શકે છે.
આ ઉપરાંત, અમારા અભ્યાસે CRS સાથે SARS-CoV-2 BGI પરીક્ષાની તુલનાત્મક કામગીરીનું મૂલ્યાંકન કર્યું, જેમાં ઉત્કૃષ્ટ હકારાત્મક ટકાવારી કરાર (PPA = 97.9%), નકારાત્મક ટકાવારી કરાર (NPA = 100%), અને લિંગ દ્વારા એકંદર ટકાવારી કરાર ( OPA). ). = 98.8%). કોહેનના કપ્પાના મૂલ્યોએ સારો કરાર દર્શાવ્યો (K = 0.975). નેધરલેન્ડ 16 અને ચાઇના15 માં થયેલા અભ્યાસોએ સતત પરિણામો દર્શાવ્યા છે. SARS-CoV-2 BGI ટેસ્ટ એ 10 μl એમ્પ્લીફિકેશન/ડિટેક્શન ઇલ્યુએટનો ઉપયોગ કરીને સિંગલ જનીન (ORF1a/b) ડિટેક્શન ટેસ્ટ છે. અમારા સંદર્ભ પરિણામો સાથે સારા આંકડાકીય કરાર હોવા છતાં, વિશ્લેષણ કુલ નમૂનાના બે હકારાત્મક નમૂનાઓ (1.22%) ચૂકી ગયું. દર્દી અને સમુદાય બંને સ્તરે ટ્રાન્સમિશન ડાયનેમિક્સ માટે આનાથી મોટી ક્લિનિકલ અસરો થઈ શકે છે.
આ અભ્યાસમાં સમાવિષ્ટ અન્ય તુલનાત્મક વિશ્લેષણ Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) એસે હતું; એકંદર મેચની ટકાવારી 96.3% હતી. કરારની મજબૂતાઈ કોહેનના કપ્પા મૂલ્ય દ્વારા પણ નક્કી કરવામાં આવી હતી, જે 0.925 હતી, જે CRS સાથે સંપૂર્ણ કરાર દર્શાવે છે. ફરીથી, અમારા પરિણામો ચાંગશા, ચીનમાં સેન્ટ્રલ સાઉથ યુનિવર્સિટી અને લિઉઝાઉ પીપલ્સ હોસ્પિટલ, લિઉઝાઉ સિટી, ચીન17ના ક્લિનિકલ લેબોરેટરી વિભાગમાં હાથ ધરવામાં આવેલા અભ્યાસો જેવા જ છે. ઉપરોક્ત સારી આંકડાકીય સુસંગતતા નોંધવામાં આવી હોવા છતાં, ચી-સ્ક્વેર ટેસ્ટ (મેકનેમર ટેસ્ટ) દર્શાવે છે કે સેન્સ્યોર બાયોટેક પરીક્ષાના પરિણામમાં CRS (p <0.005) ની સરખામણીમાં આંકડાકીય રીતે નોંધપાત્ર તફાવત છે. ઉપરોક્ત સારી આંકડાકીય સુસંગતતા નોંધવામાં આવી હોવા છતાં, ચી-સ્ક્વેર ટેસ્ટ (મેકનેમર ટેસ્ટ) દર્શાવે છે કે સેન્સ્યોર બાયોટેક પરીક્ષાના પરિણામમાં CRS (p <0.005) ની સરખામણીમાં આંકડાકીય રીતે નોંધપાત્ર તફાવત છે. Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий хи-квадрат) показал, что результат анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое различие по сравнению с CRS (p < 0,005). ઉપરોક્ત સારી આંકડાકીય સમજૂતી નોંધવામાં આવી હોવા છતાં, ચી-સ્ક્વેર ટેસ્ટ (મેકનેમર ટેસ્ટ) એ દર્શાવ્યું હતું કે સેન્સ્યોર બાયોટેક પરીક્ષાના પરિણામમાં CRS (p <0.005) ની સરખામણીમાં આંકડાકીય રીતે નોંધપાત્ર તફાવત હતો.尽管记录了上述良好的统计一致性,但卡方检验(MacNemar 检验)表明,Sansure Biotech 检测丞SCR相比具有统计学显着差异(p <0.005).આ相比 具有 显着 (((p <0.005。... Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) разницу (p < 0,005) સેન્સ્યોર બાયોટેક અને CRS. ઉપરોક્ત સારી આંકડાકીય સમજૂતી હોવા છતાં, ચી-સ્ક્વેર ટેસ્ટ (મેકનેમર ટેસ્ટ) એ Sansure બાયોટેક એસે અને CRS વચ્ચે આંકડાકીય રીતે નોંધપાત્ર તફાવત (p <0.005) દર્શાવ્યો હતો.સીઆરએસ (પૂરક કોષ્ટક 1) ની સરખામણીમાં છ નમૂનાઓ (3.66%) ખોટા નકારાત્મક હોવાનું જણાયું હતું; આ ખૂબ જ મહત્વપૂર્ણ છે, ખાસ કરીને વાયરસના પ્રસારણની ગતિશીલતાને જોતાં. ઉપરોક્ત ડેટા આ નીચા ડિટેક્શન રેટ15ને પણ સમર્થન આપે છે.
આ અભ્યાસમાં, એબોટ SARS-CoV-2 પરીક્ષામાં નોંધાયેલ સૌથી નીચો સરેરાશ Ct મૂલ્ય સાથે, દરેક પરીણ અને સંબંધિત પ્લેટફોર્મ માટે Ct મૂલ્યો નક્કી કરવામાં આવ્યા હતા. આ પરિણામ SARS-CoV-2 ની શોધ માટે એબોટની એક સાથે સંયુક્ત આનુવંશિક પરીક્ષણ સિસ્ટમ સાથે સંબંધિત હોઈ શકે છે. તેથી, આકૃતિ 1 મુજબ, એબોટ SARS-CoV-2 પરિણામોના 87.6% સીટી મૂલ્યો 20 ની નીચે હતા. માત્ર થોડા નમૂના પરિણામો (12.4%) 20-30 શ્રેણીમાં હતા. 30 થી ઉપરના Ct મૂલ્યો રેકોર્ડ કરવામાં આવ્યા ન હતા. એબોટ દ્વારા SARS-CoV-2 પેનલના આનુવંશિક પરીક્ષણ ફોર્મેટના ઉપયોગ ઉપરાંત, આ પરિણામ નીચલી શોધ મર્યાદા (32.5 RNA નકલો/mL)18 સાથે સંબંધિત હોઈ શકે છે, જે કંપનીની 100 RNA નકલોની નીચી મર્યાદા કરતાં ત્રણ ગણી ઓછી છે. /એમએલ. મિલી) 19.
આ અભ્યાસમાં કેટલીક મર્યાદાઓ છે: સૌપ્રથમ, સંસાધનોની અછતને કારણે અમારી પાસે પ્રમાણભૂત/સંદર્ભ પદ્ધતિઓ [જેમ કે વાયરલ લોડ અથવા અન્ય લેબોરેટરી પરીક્ષણો (LDA)] નથી. બીજું, આ અભ્યાસમાં વપરાતા તમામ નમુનાઓ નાસોફેરિંજલ સ્વેબ હતા, જ્યારે પરિણામો અન્ય નમૂનાના પ્રકારોને લાગુ પડતા ન હતા, અને ત્રીજું, અમારા નમૂનાનું કદ નાનું હતું.
આ અભ્યાસમાં SARS-CoV-2 માટેના ચાર rRT-PCR એસેના પ્રદર્શનની તુલના નાસોફેરિંજલ નમૂનાઓનો ઉપયોગ કરીને કરવામાં આવી હતી. સેન્સ્યોર બાયોટેક પરીક્ષાના અપવાદ સિવાય, તમામ તપાસ પરીક્ષણોમાં લગભગ તુલનાત્મક કામગીરી હતી. આ ઉપરાંત, CRS (p <0.05) ની સરખામણીમાં સેન્સ્યોર બાયોટેક પરીક્ષામાં નીચા હકારાત્મકતા દરને ઓળખવામાં આવ્યો હતો. આ ઉપરાંત, CRS (p <0.05) ની સરખામણીમાં સેન્સ્યોર બાયોટેક પરીક્ષામાં નીચા હકારાત્મકતા દરને ઓળખવામાં આવ્યો હતો. Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). વધુમાં, સેન્સ્યોર બાયોટેક ટેસ્ટે CRS (p <0.05) ની સરખામણીમાં હકારાત્મક પરિણામોની ઓછી ટકાવારી દર્શાવી હતી.此外,与CRS 相比, સેન્સ્યોર બાયોટેક 检测的阳性率较低(p <0.05).此外,与CRS 相比, સેન્સ્યોર બાયોટેક 检测的阳性率较低(p <0.05). Кроме того, анализ Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). વધુમાં, CRS (p <0.05) ની સરખામણીમાં સેન્સ્યોર બાયોટેક પરીક્ષામાં હકારાત્મકતા દર ઓછો હતો.PPA, NPA અને એકંદર કરારનું Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) વિશ્લેષણ 0.925 ના કરાર મૂલ્યની કોહેન કપ્પાની મજબૂતાઈ સાથે 93.5% ને વટાવી ગયું છે. છેલ્લે, સેન્સ્યોર બાયોટેક એસે (RUO) ને ઇથોપિયામાં ઉપયોગ માટે વધુ માન્યતાની જરૂર છે, અને વ્યક્તિગત ઉત્પાદકોના દાવાઓનું મૂલ્યાંકન કરવા માટે વધારાના સંશોધનને ધ્યાનમાં લેવું જોઈએ.
આદિસ અબાબા, એકા કોટેબે હોસ્પિટલ, મિલેનિયમ ચર્ચ ટ્રીટમેન્ટ સેન્ટર, ઝેવુડિટુ મેમોરિયલ હોસ્પિટલ અને સેન્ટ પીટર ટ્યુબરક્યુલોસિસ સ્પેશિયાલિસ્ટ હોસ્પિટલમાં ચાર આરોગ્ય સુવિધાઓમાં તુલનાત્મક અભ્યાસ ડિઝાઇન હાથ ધરવામાં આવી હતી. આ ડેટા 1 થી 31 ડિસેમ્બર, 2020 ની વચ્ચે એકત્રિત કરવામાં આવ્યો હતો. આ અભ્યાસ માટે તબીબી સુવિધાઓ હેતુપૂર્વક તેમના કેસોની સંખ્યા અને શહેરમાં મુખ્ય સારવાર કેન્દ્રોની ઉપલબ્ધતાને આધારે પસંદ કરવામાં આવી હતી. એ જ રીતે, એબીઆઈ 7500 અને એબોટ એમ2000 રીઅલ-ટાઇમ પીસીઆર સાધનો સહિતના સાધનો, NAAT રીએજન્ટ ઉત્પાદકોની ભલામણો અનુસાર પસંદ કરવામાં આવ્યા હતા, અને આ અભ્યાસ માટે ચાર પીસીઆર શોધ કીટ પસંદ કરવામાં આવી હતી, કારણ કે ઇથોપિયામાં મોટાભાગની પ્રયોગશાળાઓ ઓછામાં ઓછા ઉપયોગ કરે છે. તેમાંથી ચાર. જીન ટેસ્ટ, એબોટ SARS-CoV-2 ટેસ્ટ, Sansure Biotech ટેસ્ટ, અને SARS-CoV-2 BGI ટેસ્ટ અભ્યાસ દરમિયાન કરવામાં આવ્યો હતો).
SARS-CoV-2 માટે 1 થી 30 ડિસેમ્બર 2020 દરમિયાન EPHI સંદર્ભિત COVID-19 માટે તપાસ હેઠળની વ્યક્તિઓ પાસેથી વાયરલ ટ્રાન્સપોર્ટ મિડિયમ (VTM) (Miraclean Technology, Shenzhen, China) ના 3 ml નો ઉપયોગ કરીને પરીક્ષણ કરવામાં આવ્યું હતું. પ્રશિક્ષિત સેમ્પલ કલેક્ટર્સ દ્વારા નેસોફેરિંજલ સેમ્પલ એકત્ર કરવામાં આવ્યા હતા અને ટ્રિપલ પેકમાં EPHIને મોકલવામાં આવ્યા હતા. ન્યુક્લીક એસિડ અલગતા પહેલા, દરેક નમૂનાને એક અનન્ય ઓળખ નંબર સોંપવામાં આવે છે. મેન્યુઅલ અને સ્વચાલિત નિષ્કર્ષણ પદ્ધતિઓનો ઉપયોગ કરીને આગમન પછી તરત જ દરેક નમૂનામાંથી નિષ્કર્ષણ કરવામાં આવે છે. આમ, એબોટ m2000 ના સ્વયંસંચાલિત નિષ્કર્ષણ માટે, દરેક નમૂનામાંથી નમૂનાનું 1.3 મિલી (0.8 મિલી ડેડ વોલ્યુમ અને 0.5 મિલી એક્સ્ટ્રાક્શન ઇનલેટ વોલ્યુમ સહિત) કાઢવામાં આવ્યું હતું અને એબોટ ડીએનએ સેમ્પલ પ્રિપેરેશન સિસ્ટમ (એબોટ મોલેક્યુલર ઇન્ક. ડેસ પ્લેઇન્સ, એબોટ મોલેક્યુલર ઇન્ક. IL, USA). ) સાર્સ-કોવ-2 (EUA) ના બે રાઉન્ડની એકંદર પ્રક્રિયા (પુનઃપ્રાપ્તિ અને શોધ) માં 96 [92 નમૂનાઓ, બે શોધ નિયંત્રણો અને બે બિન-ટેમ્પલેટ નિયંત્રણો (NTC)] ની બેચનો સમાવેશ કરવામાં આવ્યો હતો. ખાણકામ એ જ રીતે, મેન્યુઅલ નિષ્કર્ષણ માટે, સમાન નમૂનાઓનો ઉપયોગ કરો (સ્વચાલિત નિષ્કર્ષણ અને શોધ માટે). આમ, સમગ્ર પ્રક્રિયા દરમિયાન, નવ રાઉન્ડમાં 24 (20 નમૂનાઓ, બે એસે કંટ્રોલ અને બે NTC સહિત) ની બેચમાં QIAamp વાયરલ RNA મિની કીટ (QIAAGEN GmbH, હિલ્ડન, જર્મની) નો ઉપયોગ કરીને 140 µl નમૂનાઓ અલગ કરવામાં આવ્યા હતા અને કાઢવામાં આવ્યા હતા. SARS-CoV-2 BGI એસે, દાન જીન એસે, અને સેન્સ્યોર બાયોટેક એસેનો ઉપયોગ કરીને ABI 7500 થર્મલ સાયકલનો ઉપયોગ કરીને મેન્યુઅલી એક્સટ્રેક્ટેડ ઇલ્યુએટ્સ એમ્પ્લીફાઇડ અને શોધવામાં આવ્યા હતા.
SARS-CoV-2 વાયરલ આરએનએનું સ્વયંસંચાલિત અલગતા અને શુદ્ધિકરણ એબોટ ડીએનએ નમૂના તૈયારી રીએજન્ટનો ઉપયોગ કરીને ચુંબકીય માળખાના સિદ્ધાંતને અનુસરે છે. પ્રોટીનને નિષ્ક્રિય કરવા અને RNase ને નિષ્ક્રિય કરવા માટે ગુઆનીડીન આઇસોથિયોસાયનેટ ધરાવતા ડીટરજન્ટનો ઉપયોગ કરીને નમૂનાઓનું નિષ્ક્રિયકરણ અને વાયરલ કણોનું દ્રાવ્યકરણ હાથ ધરવામાં આવે છે. ત્યારબાદ આરએનએને સિલિકાનો ઉપયોગ કરીને ઘન તબક્કાના વિભાજન દ્વારા પ્રોટીનથી અલગ કરવામાં આવે છે, એટલે કે ગ્વાનીડીનિયમ મીઠું અને લિસિસ બફરનું આલ્કલાઇન pH સિલિકા (SiO2) સાથે ન્યુક્લિયક એસિડના બંધનને પ્રોત્સાહન આપે છે. કોગળા કરવાનું પગલું સ્પષ્ટ સોલ્યુશન બનાવવા માટે બાકીના પ્રોટીન અને કાટમાળને દૂર કરે છે. ઇન્સ્ટ્રુમેન્ટના ચુંબકીય ક્ષેત્ર 20,21 નો ઉપયોગ કરીને પારદર્શક આરએનએ સિલિકા-આધારિત માઇક્રોપાર્ટિકલ્સથી અલગ કરવામાં આવે છે. બીજી તરફ, આરએનએનું મેન્યુઅલ આઇસોલેશન અને શુદ્ધિકરણ ચુંબકીય સ્ટેન્ડને બદલે સેન્ટ્રીફ્યુગેશનનો ઉપયોગ કરીને સ્પિન કૉલમ પદ્ધતિ દ્વારા હાથ ધરવામાં આવે છે અને એલ્યુએન્ટમાંથી માઇક્રોપાર્ટિકલ્સને અલગ કરી શકાય છે.
એબોટ રીઅલ-ટાઇમ SARS-CoV-2 ડિટેક્શન ટેસ્ટ (Abbott Molecular, Inc.) ઉત્પાદકની સૂચનાઓ અનુસાર કરવામાં આવી હતી, જેને WHO અને FDA તરફથી EUA19,22 પ્રાપ્ત થયા હતા. આ પ્રોટોકોલમાં, નિષ્કર્ષણ પહેલાં નમૂના નિષ્ક્રિયતા 30 મિનિટ માટે 56 °C પર પાણીના સ્નાનમાં કરવામાં આવી હતી. વાયરસના નિષ્ક્રિયકરણ પછી, એબોટ m2000 ડીએનએ નમૂના તૈયારી પ્રણાલીનો ઉપયોગ કરીને 0.5 મિલી વીટીએમમાંથી એબોટ m2000 SP સાધન પર ન્યુક્લિક એસિડ નિષ્કર્ષણ કરવામાં આવ્યું હતું. ઉત્પાદક અનુસાર. એબોટ m2000 RT-PCR સાધનનો ઉપયોગ કરીને એમ્પ્લીફિકેશન અને શોધ કરવામાં આવી હતી, અને RdRp અને N જનીનો માટે ડ્યુઅલ ડિટેક્શન કરવામાં આવ્યું હતું. ROX) અને VIC P (માલિકીનો રંગ) આંતરિક નિયંત્રણોના લક્ષ્યાંક અને શોધ માટે, બંને એમ્પ્લીફિકેશન ઉત્પાદનોની એક સાથે શોધની મંજૂરી આપે છે 19.
આ કિટની એમ્પ્લીફિકેશન ડિટેક્શન પદ્ધતિ વન-સ્ટેપ RT-PCR ટેક્નોલોજી પર આધારિત છે. ORF1a/b અને N જનીનોને લક્ષ્ય ક્ષેત્ર એમ્પ્લીફિકેશન શોધવા માટે દાન જીન ટેકનોલોજી દ્વારા સંરક્ષિત પ્રદેશો તરીકે પસંદ કરવામાં આવ્યા હતા. વિશિષ્ટ પ્રાઇમર્સ અને ફ્લોરોસન્ટ પ્રોબ્સ (FAM સાથે લેબલવાળી N જીન પ્રોબ્સ, VIC સાથે લેબલવાળી ORF1a/b પ્રોબ્સ) નમૂનાઓમાં SARS-CoV-2 RNA શોધવા માટે ડિઝાઇન કરવામાં આવી છે. અંતિમ એલ્યુઅન્ટ અને માસ્ટર મિક્સ 25 µl ના અંતિમ વોલ્યુમમાં માસ્ટર મિક્સના 20 µl સાથે 5 µl ઈલુઅન્ટ ઉમેરીને તૈયાર કરવામાં આવ્યા હતા. એમ્પ્લીફિકેશન અને ડિટેક્શન એબીઆઈ 750024 રીઅલ-ટાઇમ પીસીઆર ઇન્સ્ટ્રુમેન્ટ પર એક સાથે કરવામાં આવ્યા હતા.
સેન્સ્યોર બાયોટેક nCoV-2019 ન્યુક્લીક એસિડ ડાયગ્નોસ્ટિક કિટ (ફ્લોરોસન્ટ પીસીઆર શોધ) નો ઉપયોગ કરીને ORF1a/b અને N જનીનો શોધવામાં આવ્યા હતા. ORF1a/b પ્રદેશ માટે FAM ચેનલ અને N જનીન માટે ROX ચેનલ પસંદ કરીને દરેક લક્ષ્ય જનીન માટે ચોક્કસ ચકાસણીઓ તૈયાર કરો. આ એસે કીટમાં, એલ્યુએન્ટ અને માસ્ટર મિક્સ રીએજન્ટ નીચે પ્રમાણે ઉમેરવામાં આવ્યા છે: શોધ/એમ્પ્લીફિકેશન માટે 30 µl માસ્ટર મિક્સ રીએજન્ટ અને 20 µl એલ્યુટેડ નમૂના તૈયાર કરો. રીઅલ-ટાઇમ PCR ABI 750025 નો ઉપયોગ એમ્પ્લીફિકેશન/શોધ માટે કરવામાં આવ્યો હતો.
SARS-CoV-2 BGI ટેસ્ટ એ COVID-19 ના નિદાન માટે ફ્લોરોસન્ટ રીઅલ-ટાઇમ rRT-PCR કીટ છે. લક્ષ્ય ક્ષેત્ર SARS-CoV-2 જીનોમના ORF1a/b પ્રદેશમાં સ્થિત છે, જે એક જનીન શોધ પદ્ધતિ છે. વધુમાં, માનવ હાઉસકીપિંગ જનીન β-એક્ટિન એ આંતરિક રીતે નિયંત્રિત લક્ષ્ય જનીન છે. માસ્ટર મિક્સ 20 µl માસ્ટર મિક્સ રીએજન્ટ અને 10 µl એક્સ્ટ્રેક્ટેડ RNA સેમ્પલને વેલ પ્લેટ26માં ભેળવીને તૈયાર કરવામાં આવે છે. ABI 7500 ફ્લોરોસન્ટ જથ્થાત્મક રીઅલ-ટાઇમ પીસીઆર સાધનનો ઉપયોગ એમ્પ્લીફિકેશન અને શોધ માટે કરવામાં આવ્યો હતો. તમામ ન્યુક્લીક એસિડ એમ્પ્લીફિકેશન, દરેક પરીક્ષા માટે PCR રન શરતો અને પરિણામોનું અર્થઘટન સંબંધિત ઉત્પાદકની સૂચનાઓ અનુસાર કરવામાં આવ્યું હતું (કોષ્ટક 3).
આ તુલનાત્મક પૃથ્થકરણમાં, અમે ચાર વિશ્લેષણો માટે ટકા કરાર (હકારાત્મક, નકારાત્મક અને એકંદર) અને અન્ય સરખામણી પરિમાણો નક્કી કરવા સંદર્ભ માનક પદ્ધતિનો ઉપયોગ કર્યો નથી. દરેક પરીક્ષણની સરખામણી CRS સાથે કરવામાં આવી હતી, આ અભ્યાસમાં CRS નિયમ "કોઈપણ સકારાત્મક" દ્વારા સેટ કરવામાં આવ્યું હતું અને પરિણામ નક્કી કરવામાં આવ્યું હતું, એક પરીક્ષણ દ્વારા નહીં, અમે ઓછામાં ઓછા બે મેળ ખાતા પરીક્ષણ પરિણામોનો ઉપયોગ કર્યો હતો. વધુમાં, COVID-19 ટ્રાન્સમિશનના કિસ્સામાં, ખોટા નકારાત્મક પરિણામો ખોટા હકારાત્મક પરિણામો કરતાં વધુ ખતરનાક છે. તેથી, CRS પરિણામમાંથી શક્ય તેટલું સચોટપણે "સકારાત્મક" કહેવા માટે, ઓછામાં ઓછા બે પરીક્ષણો સકારાત્મક હોવા જોઈએ, એટલે કે EUA પરીક્ષામાંથી ઓછામાં ઓછું એક હકારાત્મક પરિણામ આવવાની શક્યતા છે. આમ, ચાર પરીક્ષણ પરિણામોમાંથી, બે અથવા વધુ પરીક્ષણ પરિણામો જે સમાન પરિણામ આપે છે તે સાચા હકારાત્મક અથવા નકારાત્મક 18,27 ગણવામાં આવે છે.
સંરચિત ડેટા નિષ્કર્ષણ સ્વરૂપોનો ઉપયોગ કરીને ડેટા એકત્રિત કરવામાં આવ્યો હતો, એક્સેલ આંકડાકીય સોફ્ટવેર અને વર્ણનાત્મક આંકડાઓ માટે SPSS સંસ્કરણ 23.0 નો ઉપયોગ કરીને ડેટા એન્ટ્રી અને વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું. હકારાત્મક, નકારાત્મક અને એકંદર ટકા કરારનું વિશ્લેષણ કરવામાં આવ્યું હતું, અને CRS સાથે દરેક પદ્ધતિના કરારની ડિગ્રી નક્કી કરવા માટે કપ્પા સ્કોરનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતો. કપ્પા મૂલ્યોનું અર્થઘટન નીચે મુજબ છે: હળવા કરાર માટે 0.01 થી 0.20, સામાન્ય કરાર માટે 0.21 થી 0.40, મધ્યમ કરાર માટે 0.41-0.60, મુખ્ય કરાર માટે 0.61-0.80 અને સંપૂર્ણ કરાર માટે 0.81-0.99 28.
એડિસ અબાબા યુનિવર્સિટીમાંથી નૈતિક મંજૂરી મેળવવામાં આવી હતી અને આ અભ્યાસ માટેના તમામ પ્રાયોગિક પ્રોટોકોલને ઇથોપિયન પબ્લિક હેલ્થ ઇન્સ્ટિટ્યૂટના સાયન્ટિફિક એથિક્સ રિવ્યુ બોર્ડ દ્વારા મંજૂરી આપવામાં આવી હતી. EPHI એથિક્સ લાયસન્સ માટે સંદર્ભ નંબર EPHI/IRB-279-2020 છે. તમામ પદ્ધતિઓ કોવિડ-19 ની સારવાર માટે ઇથોપિયન રાષ્ટ્રીય વ્યાપક માર્ગદર્શિકાની ભલામણો અને જોગવાઈઓ અનુસાર લાગુ કરવામાં આવી હતી. વધુમાં, અભ્યાસમાં ભાગ લેતા પહેલા તમામ અભ્યાસ સહભાગીઓ પાસેથી લેખિત જાણકાર સંમતિ મેળવવામાં આવી હતી.
આ અધ્યયનમાં મેળવેલ અથવા વિશ્લેષણ કરવામાં આવેલ તમામ ડેટા આ પ્રકાશિત લેખમાં સમાવવામાં આવેલ છે. આ અભ્યાસના પરિણામોને સમર્થન આપતો ડેટા સંબંધિત લેખક પાસેથી વાજબી વિનંતી પર ઉપલબ્ધ છે.
વિશ્વ આરોગ્ય સંસ્થા. કોવિડ-19 માટે પ્રયોગશાળા પરીક્ષણ વ્યૂહરચનાઓ માટેની ભલામણો: વચગાળાનું માર્ગદર્શન, 21 માર્ચ, 2020 નંબર WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO, 2020).
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 ઇમરજન્સી વિભાગમાં સ્માર્ટ ડાયગ્નોસિસ: ઑલ-ઇન પ્રેક્ટિસ. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 ઇમરજન્સી વિભાગમાં સ્માર્ટ ડાયગ્નોસિસ: ઑલ-ઇન પ્રેક્ટિસ.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. અને Gurgulianis, KI ઇમરજન્સી વિભાગમાં COVID-19 નું બુદ્ધિશાળી નિદાન: વ્યવહારમાં બધું.Muliou DS, Pantazopoulos I. અને Gurgulyanis KI કટોકટી વિભાગોમાં COVID-19 નું બુદ્ધિશાળી નિદાન: વ્યવહારમાં અંત-થી-અંત એકીકરણ. નિષ્ણાત રેવરેન્ડ રેસ્પાયર. દવા. 3, 263–272 (2022).
મિશેલ, SL અને સેન્ટ જ્યોર્જ, K. COVID19 ID NOW EUA પરીક્ષાનું મૂલ્યાંકન. મિશેલ, SL અને સેન્ટ જ્યોર્જ, K. COVID19 ID NOW EUA પરીક્ષાનું મૂલ્યાંકન.મિશેલ, એસએલ અને સેન્ટ જ્યોર્જ, કે. COVID19 ID NOW EUA પરીક્ષાનું મૂલ્યાંકન.મિશેલ SL અને સેન્ટ જ્યોર્જ કે. COVID19 ID NOW EUA પરીક્ષાનું મૂલ્યાંકન. જે. ક્લિનિકલ. વાઇરસ. 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
WHO. શંકાસ્પદ માનવ રોગમાં કોરોનાવાયરસ રોગ 2019 (COVID-19) ની લેબોરેટરી શોધ. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (15 ઓગસ્ટ 2020ના રોજ એક્સેસ કરેલ) (WHO, 2020).
ઉદુગામા, બી. એટ અલ. COVID-19 નિદાન: રોગો અને પરીક્ષણ સાધનો. ACS નેનો 14(4), 3822–3835 (2020).
સૈયદ એસ. વગેરે. પૂર્વીય, મધ્ય અને દક્ષિણ આફ્રિકાના પેથોલોજીસ્ટ કોલેજની સ્થાપના - મધ્ય પૂર્વ અને દક્ષિણ આફ્રિકાની પેથોલોજીની પ્રાદેશિક શાળા. આફ્રિકા. જે. લેબ. દવા. 9(1), 1-8 (2020).
ઇથોપિયન ઇન્સ્ટિટ્યૂટ ઑફ પબ્લિક હેલ્થ, ફેડરલ મિનિસ્ટ્રી ઑફ હેલ્થ. કોવિડ-19ના પ્રયોગશાળા નિદાન માટે વચગાળાની રાષ્ટ્રીય વ્યૂહરચના અને માર્ગદર્શન. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (એક્સેસ 12 ઓગસ્ટ 2020) (EPHI, 2020).
વોલોશિન, એસ., પટેલ, એન. અને કેસેલહેમ, AS SARS-CoV-2 ચેપના પડકારો અને અસરો માટે ખોટા નકારાત્મક પરીક્ષણો. વોલોશિન, એસ., પટેલ, એન. અને કેસેલહેમ, AS SARS-CoV-2 ચેપના પડકારો અને અસરો માટે ખોટા નકારાત્મક પરીક્ષણો.વોલોશિન એસ., પટેલ એન. અને કેસેલહેમ એએસ SARS-CoV-2 ચેપ અને તેના પરિણામો માટે ખોટા-નેગેટિવ પરીક્ષણો.વોલોશિન એસ., પટેલ એન. અને કેસેલહેમ એએસ ઉશ્કેરણી અને SARS-CoV-2 ચેપની અસર માટે ખોટા-નકારાત્મક પરીક્ષણો. એન. એન્જી. જે. દવા. 383(6), e38 (2020).
મૌલિઓ, ડીએસ અને ગૌરગૌલિઆનિસ, KI ખોટા-સકારાત્મક અને ખોટા-નકારાત્મક COVID-19 કેસો: શ્વસન નિવારણ અને વ્યવસ્થાપન વ્યૂહરચના, રસીકરણ અને આગળના પરિપ્રેક્ષ્યો. મૌલિઓ, ડીએસ અને ગૌરગૌલિઆનિસ, KI ખોટા-સકારાત્મક અને ખોટા-નકારાત્મક COVID-19 કેસો: શ્વસન નિવારણ અને વ્યવસ્થાપન વ્યૂહરચના, રસીકરણ અને આગળના પરિપ્રેક્ષ્યો. મૌલીઓ, ડીએસ અને ગૌરગૌલિઆનિસ, KI LOJNOPOLOJITELNые и ложноотрицательные случаи COVID-19: респираторная профилактика и стратегияцивация, dalneйшие перспективы. મૌલીઓ, ડીએસ અને ગૌરગૌલીનીસ, KI કોવિડ-19ના ખોટા હકારાત્મક અને ખોટા નકારાત્મક કેસો: શ્વસન નિવારણ અને સારવારની વ્યૂહરચના, રસીકરણ અને આગળનો માર્ગ.મુલીયુ, ડીએસ અને ગુરગુલિયાનિસ, KI કોવિડ-19ના ખોટા-પોઝિટિવ અને ખોટા-નકારાત્મક કેસો: શ્વસન નિવારણ અને સારવાર, રસીકરણ અને આગળના માર્ગ માટેની વ્યૂહરચના. નિષ્ણાત રેવરેન્ડ રેસ્પાયર. દવા. 15(8), 993–1002 (2021).
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. ઇમરજન્સી વિભાગમાં COVID-19 નિદાન: વૃક્ષ જોવું પણ જંગલ ગુમાવવું. Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. ઇમરજન્સી વિભાગમાં COVID-19 નિદાન: વૃક્ષ જોવું પણ જંગલ ગુમાવવું.મૌલિયુ, ડીએસ, આયોનિસ, પી. અને કોન્સ્ટેન્ટિનોસ, જી. કટોકટી વિભાગમાં કોવિડ-19 નિદાન: વૃક્ષ જુઓ, જંગલ ગુમાવો.મુલીઉ ડીએસ, આયોનિસ પી. અને કોન્સ્ટેન્ટિનોસ જી. ઇમરજન્સી રૂમમાં કોવિડ-19 નિદાન: વૃક્ષો માટે પૂરતું જંગલ નથી. દેખાય છે. દવા. J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
ડેગલી-એન્જેલી, ઇ. એટ અલ. એબોટ રીયલ ટાઈમ SARS-CoV-2 એસેના વિશ્લેષણાત્મક અને ક્લિનિકલ પ્રદર્શનની માન્યતા અને માન્યતા. જે. ક્લિનિકલ. વાઇરસ. 129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. પરંપરાગત RT-PCR દ્વારા વાયરસના ચેપની શોધ માટે COVID-19 ના વિવિધ જીનોમ પ્રદેશમાંથી પાંચ પ્રાઈમર સેટની સરખામણી. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. પરંપરાગત RT-PCR દ્વારા વાયરસના ચેપની શોધ માટે COVID-19 ના વિવિધ જીનોમ પ્રદેશોમાંથી પાંચ પ્રાઈમર સેટની સરખામણી.Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. અને Aflatunyan, B. પરંપરાગત RT-PCR દ્વારા વાયરલ ચેપની તપાસ માટે COVID-19 જીનોમના વિવિધ પ્રદેશોમાંથી પ્રાઇમરના પાંચ સેટની સરખામણી. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. 比较来自COVID-19不同基因组区域的五个引物组,用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. પરંપરાગત RT-PCR દ્વારા વાયરલ ચેપની શોધ માટે COVID-19 ના 5 જુદા જુદા આનુવંશિક પ્રદેશોની સરખામણી.Mollaei HR, Afshar AA, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. અને Aflatunyan B. પરંપરાગત RT-PCR દ્વારા વાયરલ ચેપની તપાસ માટે COVID-19 જીનોમના વિવિધ પ્રદેશોમાંથી પ્રાઈમરના પાંચ સેટની સરખામણી.ઈરાન. જે. માઇક્રોબાયોલોજી. 12(3), 185 (2020).
ગોર્ટઝર, આઇ. એટ અલ. SARS-CoV-2 જીનોમ સિક્વન્સની શોધ માટે રાષ્ટ્રીય બાહ્ય ગુણવત્તા મૂલ્યાંકન કાર્યક્રમના પ્રારંભિક પરિણામો. જે. ક્લિનિકલ. વાઇરસ. 129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
વાંગ, એમ. એટ અલ. ગંભીર એક્યુટ રેસ્પિરેટરી સિન્ડ્રોમ કોરોનાવાયરસ માટે પાંચ આરટી-પીસીઆર કીટની અસરકારકતાનું વિશ્લેષણાત્મક મૂલ્યાંકન 2. જે. ક્લિનિકલ. પ્રયોગશાળા ગુદા 35(1), e23643 (2021).
વાંગ બી. એટ અલ. રીઅલ-ટાઇમ પોલિમરેઝ ચેઇન રિએક્શન (PCR) પર આધારિત ચીનમાં સાત વ્યાવસાયિક રીતે ઉપલબ્ધ SARS-CoV-2 RNA ડિટેક્શન કીટનું મૂલ્યાંકન. ક્લિનિકલ કેમિકલ. પ્રયોગશાળા દવા. 58(9), e149–e153 (2020).
વાન કાસ્ટેરેન, પીબી એટ અલ. સાત કોમર્શિયલ RT-PCR COVID-19 ડાયગ્નોસ્ટિક કીટની સરખામણી. જે. ક્લિનિકલ. વાઇરસ. 128, 104412 (2020).
લુ, યુ, એટ અલ. SARS-CoV-2 ન્યુક્લીક એસિડની તપાસ માટે બે PCR કિટના ડાયગ્નોસ્ટિક કામગીરીની સરખામણી. જે. ક્લિનિકલ. પ્રયોગશાળા ગુદા 34(10), e23554 (2020).
Lefart, PR, વગેરે. ચાર SARS-CoV-2 ન્યુક્લીક એસિડ એમ્પ્લીફિકેશન ટેસ્ટિંગ (NAAT) પ્લેટફોર્મનો તુલનાત્મક અભ્યાસ દર્શાવે છે કે ID NOW ની કામગીરી દર્દી અને નમૂનાના પ્રકારને આધારે નોંધપાત્ર રીતે બગડેલી હતી. નિદાન માઇક્રોબાયોલોજી. સંક્રમિત કરો. diss 99(1), 115200 (2021).
એબોટ પરમાણુ. એબોટ રીઅલ-ટાઇમ SARS-CoV-2 વિશ્લેષણ પેકેજ દાખલ કરે છે. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay. 1-12. (10 ઓગસ્ટ, 2020 મુજબ) (2020).
ક્લેઈન, એસ. એટ અલ. RT-qPCR અને RT-LAMP દ્વારા ઝડપી મોટા પાયે શોધ માટે ચુંબકીય માળખાનો ઉપયોગ કરીને SARS-CoV-2 RNA અલગતા. વાયરસ 12(8), 863 (2020).


પોસ્ટનો સમય: ડિસેમ્બર-08-2022
ગોપનીયતા સેટિંગ્સ
કૂકી સંમતિ મેનેજ કરો
શ્રેષ્ઠ અનુભવો પ્રદાન કરવા માટે, અમે ઉપકરણ માહિતી સંગ્રહિત કરવા અને/અથવા ઍક્સેસ કરવા માટે કૂકીઝ જેવી તકનીકોનો ઉપયોગ કરીએ છીએ. આ તકનીકોને સંમતિ આપવાથી અમને આ સાઇટ પર બ્રાઉઝિંગ વર્તન અથવા અનન્ય ID જેવા ડેટા પર પ્રક્રિયા કરવાની મંજૂરી મળશે. સંમતિ ન આપવી અથવા સંમતિ પાછી ખેંચી લેવી, કેટલીક વિશેષતાઓ અને કાર્યોને પ્રતિકૂળ અસર કરી શકે છે.
✔ સ્વીકાર્યું
✔ સ્વીકારો
નકારો અને બંધ કરો
X